Трепанация позволяет создать доступ к внутренней части зуба и корневым каналам. Если на зубе установлена искусственная коронка, в некоторых ситуациях доступ формируют через нее.
После создания доступа стоматолог находит устья каналов и выполняет дальнейшее эндодонтическое лечение. Отверстие впоследствии восстанавливают подходящим материалом.